HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Ipomoea_nil.XP_019155536.1@@35883

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

XP_019155536.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Bacteria.Bacteria
DN time

3936.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.Mesangiospermae
RN time

160.0
MSMH OUT

Bacteria.Alphaproteobacteria--NA--Mesorhizobium_ciceri.YP_004143595.1@@39645
AI(CHE)

20.54(86.67)
hU(CHS)

52.9(86.67)
hBL(CHBL)

1.02(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Viridiplantae--Tracheophyta--Ipomoni.XP_019155536.1@@35883
Viridiplantae--Tracheophyta--Prosoal.XP_028798702.1@@207710
Viridiplantae--Tracheophyta--Prosoal.XP_028753818.1@@207710
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Camelina_sativa.XP_010503556.1@@90675
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Brassica_napus.XP_013642425.1@@3708
Plantae.Viridiplantae--Rosales--Malus_domestica.XP_017184554.1@@3750
Plantae.Viridiplantae--Liliopsida--Oryza_brachyantha.XP_006658060.1@@4533

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.2567
EGGNOG Term

COG0103@1|root,KOG1697@2759|Eukaryota,37HX7@33090|Viridiplantae,3GC8I@35493|Streptophyta,44D56@71274|asterids
PANTHER Term

PTHR21569:SF1
Super Family Term

SSF54211
Interproscan Term
- ['IPR000754', 'IPR020568']
GO Term
- GO:0000462
- GO:0003674
- GO:0003676
- GO:0003723
- GO:0003735
- GO:0005198
- GO:0005488
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005737
- GO:0005739
- GO:0005840
- GO:0006139
- GO:0006364
- GO:0006396
- GO:0006412
- GO:0006518
- GO:0006725
- GO:0006807
- GO:0007275
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0009058
- GO:0009059
- GO:0009553
- GO:0009555
- GO:0009559
- GO:0009561
- GO:0009987
- GO:0010467
- GO:0015935
- GO:0016070
- GO:0016072
- GO:0019538
- GO:0022613
- GO:0030154
- GO:0030490
- GO:0032501
- GO:0032502
- GO:0032991
- GO:0034470
- GO:0034641
- GO:0034645
- GO:0034660
- GO:0042254
- GO:0042274
- GO:0043043
- GO:0043170
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043228
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043232
- GO:0043603
- GO:0043604
- GO:0044085
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044249
- GO:0044260
- GO:0044267
- GO:0044271
- GO:0044391
- GO:0044422
- GO:0044424
- GO:0044444
- GO:0044446
- GO:0044464
- GO:0046483
- GO:0048229
- GO:0048856
- GO:0048869
- GO:0071704
- GO:0071840
- GO:0090304
- GO:0097159
- GO:1901360
- GO:1901363
- GO:1901564
- GO:1901566
- GO:1901576
- GO:1990904
Pfam Term
- PF00380
KO Term

ko03010,map03010