HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Arabidopsis_thaliana.NP_001190341.1@@3702

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

NP_001190341.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Eukaryota.Chromalveolate.Chromalveolate
DN time

1490.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.rosids
RN time

110.0
MSMH OUT

Chromalveolata.Stramenopiles--Oomycetes--Phytophthora_parasitica.XP_008909580.1@@4792
AI(CHE)

37.0(100.0)
hU(CHS)

145.0(100.0)
hBL(CHBL)

98.07(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Plantae.Viridiplantae--Brassical--Arabidopsis_lyrata.XP_020879088.1@@59689
Viridiplantae--Tracheophyta--Arabith.NP_001190341.1@@3702
Viridiplantae--Tracheophyta--Arabith.NP_001318604.1@@3702
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Capsella_rubella.XP_006287457.1@@81985
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Eutrema_salsugineum.XP_006400543.1@@72664
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Camelina_sativa.XP_010454268.1@@90675
Viridiplantae--Tracheophyta--Eutresa.XP_006400543.2@@72664
Viridiplantae--Tracheophyta--Raphasa.XP_018472806.1@@3726
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Brassica_oleracea.XP_013625635.1@@3712
Viridiplantae--Tracheophyta--Raphasa.XP_018472805.1@@3726
Viridiplantae--Tracheophyta--Eutresa.XP_024012714.1@@72664
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Camelina_sativa.XP_019084214.1@@90675
Plantae.Viridiplantae--Malpighia--Populus_trichocarpa.XP_002307611.2@@3694
Plantae.Viridiplantae--Rosales--Prunus_mume.XP_008235355.1@@102107
Plantae.Viridiplantae--Fabales--Vigna_angularis.XP_017415056.1@@3914
Plantae.Viridiplantae--Malpighia--Ricinus_communis.XP_015572895.1@@3988

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.488
EGGNOG Term

2CN15@1|root,2QT8Y@2759|Eukaryota,37Q4U@33090|Viridiplantae,3GCJJ@35493|Streptophyta,3HSV5@3699|Brassicales
PANTHER Term

PTHR12461
Super Family Term

SSF51197
Interproscan Term
- None
GO Term
- GO:0000086
- GO:0000278
- GO:0003674
- GO:0003682
- GO:0003824
- GO:0005488
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005634
- GO:0006325
- GO:0006355
- GO:0006464
- GO:0006482
- GO:0006807
- GO:0006996
- GO:0007049
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0008214
- GO:0009889
- GO:0009891
- GO:0009893
- GO:0009987
- GO:0010468
- GO:0010556
- GO:0010557
- GO:0010604
- GO:0010628
- GO:0016043
- GO:0016491
- GO:0016569
- GO:0016570
- GO:0016577
- GO:0016705
- GO:0016706
- GO:0019219
- GO:0019222
- GO:0019538
- GO:0022402
- GO:0031323
- GO:0031325
- GO:0031326
- GO:0031328
- GO:0032451
- GO:0032452
- GO:0036211
- GO:0043170
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043412
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044260
- GO:0044267
- GO:0044424
- GO:0044464
- GO:0044770
- GO:0044772
- GO:0044839
- GO:0045893
- GO:0045935
- GO:0048518
- GO:0048522
- GO:0050789
- GO:0050794
- GO:0051171
- GO:0051173
- GO:0051213
- GO:0051252
- GO:0051254
- GO:0051276
- GO:0051864
- GO:0055114
- GO:0060255
- GO:0065007
- GO:0070076
- GO:0070544
- GO:0070988
- GO:0071704
- GO:0071840
- GO:0080090
- GO:0140096
- GO:1901564
- GO:1902680
- GO:1903047
- GO:1903506
- GO:1903508
- GO:2000112
- GO:2001141
Pfam Term
- PF13621