HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Arabidopsis_thaliana.NP_850666.1@@3702

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

NP_850666.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Eukaryota.Chromalveolate.Chromalveolate
DN time

1490.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.Mesangiospermae
RN time

160.0
MSMH OUT

Chromalveolata.Haptophyceae--Phaeocystales--Phaeocystis_antarctica.Caron_Lab.10138_1@@33657
AI(CHE)

92.64(100.0)
hU(CHS)

301.0(100.0)
hBL(CHBL)

98.84(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Viridiplantae--Tracheophyta--Eutresa.XP_006404378.1@@72664
Viridiplantae--Tracheophyta--Raphasa.XP_018433433.1@@3726
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Capsella_rubella.XP_006290796.1@@81985
Viridiplantae--Tracheophyta--Arabith.NP_190329.2@@3702
Viridiplantae--Tracheophyta--Eutresa.XP_024013721.1@@72664
Viridiplantae--Tracheophyta--Tarenha.XP_010547825.1@@28532
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Gossypium_raimondii.XP_012439136.1@@29730
Plantae.Viridiplantae--Sapindales--Citrus_clementina.XP_006421650.1@@85681
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Theobroma_cacao.XP_017972284.1@@3641
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Theobroma_cacao.XP_017972281.1@@3641
Plantae.Viridiplantae--Cucurbita--Cucumis_melo.XP_008467308.1@@3656
Plantae.Viridiplantae--Fabales--Phaseolus_vulgaris.XP_007131460.1@@3885
Plantae.Viridiplantae--Solanales--Solanum_pennellii.XP_015070443.1@@28526
Plantae.Viridiplantae--Liliopsida--Setaria_italica.XP_012703895.1@@4555
Viridiplantae--Tracheophyta--Ananaco.XP_020113133.1@@4615
Plantae.Viridiplantae--Liliopsida--Phoenix_dactylifera.XP_017699183.1@@42345

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.4038
EGGNOG Term

COG1161@1|root,KOG1249@2759|Eukaryota,37N2S@33090|Viridiplantae,3G80S@35493|Streptophyta,3HRSM@3699|Brassicales
PANTHER Term

PTHR47569
Super Family Term

SSF52540
Interproscan Term
- ['IPR027417']
GO Term
- GO:0000302
- GO:0001101
- GO:0001505
- GO:0003674
- GO:0003824
- GO:0003924
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005737
- GO:0005739
- GO:0006109
- GO:0006807
- GO:0006809
- GO:0006950
- GO:0006970
- GO:0006979
- GO:0006996
- GO:0007275
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0009058
- GO:0009507
- GO:0009536
- GO:0009628
- GO:0009651
- GO:0009657
- GO:0009668
- GO:0009889
- GO:0009987
- GO:0010027
- GO:0010035
- GO:0010193
- GO:0010322
- GO:0010565
- GO:0010675
- GO:0016043
- GO:0016462
- GO:0016787
- GO:0016817
- GO:0016818
- GO:0017111
- GO:0017144
- GO:0019216
- GO:0019220
- GO:0019222
- GO:0019747
- GO:0022613
- GO:0031323
- GO:0031326
- GO:0032501
- GO:0032502
- GO:0034641
- GO:0042133
- GO:0042136
- GO:0042221
- GO:0042254
- GO:0042493
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0044085
- GO:0044237
- GO:0044249
- GO:0044271
- GO:0044424
- GO:0044444
- GO:0044464
- GO:0046209
- GO:0046677
- GO:0046890
- GO:0048366
- GO:0048367
- GO:0048731
- GO:0048827
- GO:0048856
- GO:0050789
- GO:0050794
- GO:0050896
- GO:0051171
- GO:0051174
- GO:0051246
- GO:0060255
- GO:0061024
- GO:0062012
- GO:0065007
- GO:0065008
- GO:0071071
- GO:0071840
- GO:0072593
- GO:0080090
- GO:0099402
- GO:1901700
- GO:1903409
- GO:1903725
- GO:2001057
Pfam Term
- PF01926
KO Term

ko00220,ko00330,ko01100,ko01110,ko01130,ko04626,map00220,map00330,map01100,map01110,map01130,map04626