HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Raphanus_sativus.XP_018493519.1@@3726

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

XP_018493519.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Eukaryota.Metazoa.Bilateria
DN time

824.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.Pentapetalae
RN time

117.0
MSMH OUT

Opisthokonta.Metazoa--Deuterostomia--Piliocolobus_tephrosceles.XP_023087754.1@@591936
AI(CHE)

10.38(100.0)
hU(CHS)

28.9(100.0)
hBL(CHBL)

1.44(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Viridiplantae--Tracheophyta--Raphasa.XP_018493519.1@@3726
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Brassica_oleracea.XP_013591932.1@@3712
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Camelina_sativa.XP_010500962.1@@90675
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Arabidopsis_lyrata.XP_002894431.1@@59689
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Brassica_rapa.XP_009147615.1@@3711
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Arabidopsis_lyrata.XP_020887589.1@@59689
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Gossypium_hirsutum.XP_016702524.1@@3635
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Gossypium_raimondii.XP_012441270.1@@29730
Plantae.Viridiplantae--Fabales--Phaseolus_vulgaris.XP_007133193.1@@3885
Plantae.Viridiplantae--Malpighia--Populus_trichocarpa.XP_002300424.2@@3694
Plantae.Viridiplantae--Solanales--Solanum_tuberosum.XP_006358946.1@@4113
Viridiplantae--Tracheophyta--Oleaeu.XP_022890071.1@@4146
Viridiplantae--Tracheophyta--Oleaeu.XP_022890070.1@@4146
Viridiplantae--Tracheophyta--Oleaeu.XP_022895409.1@@4146

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.45
EGGNOG Term

KOG0118@1|root,KOG0118@2759|Eukaryota,37PR4@33090|Viridiplantae,3GBND@35493|Streptophyta,3HMQ1@3699|Brassicales
PANTHER Term

PTHR15241:SF260
Super Family Term

SSF54928
Interproscan Term
- ['IPR035979']
GO Term
- GO:0002237
- GO:0003674
- GO:0003676
- GO:0003723
- GO:0003729
- GO:0003730
- GO:0005488
- GO:0005515
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005634
- GO:0005654
- GO:0005737
- GO:0005849
- GO:0006139
- GO:0006378
- GO:0006379
- GO:0006396
- GO:0006397
- GO:0006725
- GO:0006807
- GO:0006950
- GO:0006952
- GO:0006954
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0009605
- GO:0009607
- GO:0009617
- GO:0009892
- GO:0009893
- GO:0009894
- GO:0009895
- GO:0009987
- GO:0010033
- GO:0010467
- GO:0010468
- GO:0010604
- GO:0010605
- GO:0010608
- GO:0010628
- GO:0016070
- GO:0016071
- GO:0017091
- GO:0019219
- GO:0019222
- GO:0019899
- GO:0019900
- GO:0019901
- GO:0031123
- GO:0031124
- GO:0031323
- GO:0031324
- GO:0031329
- GO:0031330
- GO:0031974
- GO:0031981
- GO:0032496
- GO:0032991
- GO:0033993
- GO:0034641
- GO:0042221
- GO:0043170
- GO:0043207
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043233
- GO:0043487
- GO:0043488
- GO:0043489
- GO:0043631
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044422
- GO:0044424
- GO:0044428
- GO:0044446
- GO:0044451
- GO:0044464
- GO:0045934
- GO:0046483
- GO:0048255
- GO:0048518
- GO:0048519
- GO:0048523
- GO:0050789
- GO:0050794
- GO:0050896
- GO:0051171
- GO:0051172
- GO:0051252
- GO:0051253
- GO:0051704
- GO:0051707
- GO:0060255
- GO:0061013
- GO:0065007
- GO:0065008
- GO:0070013
- GO:0070935
- GO:0071704
- GO:0080090
- GO:0090304
- GO:0090305
- GO:0090501
- GO:0097159
- GO:1901360
- GO:1901363
- GO:1901700
- GO:1902369
- GO:1902373
- GO:1903311
- GO:1903312
Pfam Term
- PF00076
KO Term

ko03040,map03040