HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Cynara_cardunculus.XP_024969982.1@@4265

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

XP_024969982.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Bacteria.Bacteria
DN time

3936.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.Pentapetalae
RN time

117.0
MSMH OUT

Bacteria.Aquificae--Aquificae--Desulfurobacterium_thermolithotrophum.WP_013638608.1@@64160
AI(CHE)

5.98(86.21)
hU(CHS)

14.3(82.76)
hBL(CHBL)

0.49(82.76)
Node Level

1

MSMH IN

Viridiplantae--Tracheophyta--Oleaeu.XP_022889789.1@@4146
Viridiplantae--Tracheophyta--Cucurpe.XP_023515246.1@@3663
Viridiplantae--Tracheophyta--Cucurpe.XP_023514490.1@@3663
Viridiplantae--Tracheophyta--Oleaeu.XP_022889790.1@@4146

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.1379
EGGNOG Term

COG0236@1|root,KOG1748@2759|Eukaryota,37VCX@33090|Viridiplantae,3GJFK@35493|Streptophyta
Super Family Term

SSF47336
Interproscan Term
- ['IPR036736']
GO Term
- GO:0000035
- GO:0000036
- GO:0002376
- GO:0003674
- GO:0005488
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005737
- GO:0005829
- GO:0005975
- GO:0006082
- GO:0006629
- GO:0006631
- GO:0006633
- GO:0006643
- GO:0006644
- GO:0006664
- GO:0006793
- GO:0006796
- GO:0006950
- GO:0006952
- GO:0006955
- GO:0007275
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0008610
- GO:0008654
- GO:0009058
- GO:0009245
- GO:0009247
- GO:0009311
- GO:0009312
- GO:0009507
- GO:0009536
- GO:0009605
- GO:0009607
- GO:0009627
- GO:0009814
- GO:0009987
- GO:0016051
- GO:0016053
- GO:0019637
- GO:0019752
- GO:0019842
- GO:0031177
- GO:0032501
- GO:0032502
- GO:0032787
- GO:0033218
- GO:0036094
- GO:0042335
- GO:0043167
- GO:0043168
- GO:0043207
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043436
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044249
- GO:0044255
- GO:0044281
- GO:0044283
- GO:0044424
- GO:0044444
- GO:0044464
- GO:0044620
- GO:0045087
- GO:0046394
- GO:0046467
- GO:0046493
- GO:0048037
- GO:0048856
- GO:0050896
- GO:0051192
- GO:0051704
- GO:0051707
- GO:0071704
- GO:0072330
- GO:0072341
- GO:0090407
- GO:0098542
- GO:0140104
- GO:1901135
- GO:1901137
- GO:1901269
- GO:1901271
- GO:1901576
- GO:1903509
Pfam Term
- PF00550