HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Rhodophyta--Rhodophyta--Gracilariopsis_chorda.PXF46831.1@@448386

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

PXF46831.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Eukaryota.Chromalveolate.Chromalveolate
DN time

1490.0
Receptor Node

Eukaryota.Rhodophyta.Rhodophyta
RN time

1333.0
MSMH OUT

Chromalveolate.Cryptophyta--Geminigeracea--Hanusia_phi.CCMP325.2462_1@@3032
AI(CHE)

49.69(85.19)
hU(CHS)

218.0(85.19)
hBL(CHBL)

0.88(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Rhodophyta--Gigartinaceae--Chondcr.XP_005714987.1@@2769
Rhodophyta--Gracilariaceae--Gracich.PXF46831.1@@448386
Plantae.Rhodophyta--eurhodo--Calliarthron_ORF_28885_26@@48940
Rhodophyta--Madagascaria--Madager.CAMPEP_0198322006@@753684
Rhodophyta--Porphyra--Porphum.OSX75065.1@@2786
Plantae.Rhodophyta--Protorhodo--Erythrolobus_madagascarensis.MMETSP1354.4875_1@@708628
Rhodophyta--Rhodella--Rhodevi.CAMPEP_0174914134@@2801
Plantae.Rhodophyta--Protorhodo--Rhodosorus_marinus.MMETSP0315.591_1@@101924

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.190
EGGNOG Term

COG0661@1|root,KOG1235@2759|Eukaryota
PANTHER Term

PTHR10566
Super Family Term

SSF56112
Interproscan Term
- ['IPR011009']
GO Term
- GO:0001101
- GO:0003674
- GO:0003824
- GO:0004672
- GO:0004674
- GO:0004693
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005634
- GO:0005737
- GO:0006464
- GO:0006468
- GO:0006793
- GO:0006796
- GO:0006807
- GO:0006950
- GO:0006979
- GO:0006995
- GO:0006996
- GO:0007154
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0009267
- GO:0009314
- GO:0009414
- GO:0009415
- GO:0009416
- GO:0009507
- GO:0009532
- GO:0009536
- GO:0009570
- GO:0009605
- GO:0009628
- GO:0009639
- GO:0009642
- GO:0009644
- GO:0009657
- GO:0009658
- GO:0009987
- GO:0009991
- GO:0010035
- GO:0010114
- GO:0010287
- GO:0016043
- GO:0016301
- GO:0016310
- GO:0016740
- GO:0016772
- GO:0016773
- GO:0019538
- GO:0031279
- GO:0031647
- GO:0031667
- GO:0031668
- GO:0031669
- GO:0033554
- GO:0036211
- GO:0042221
- GO:0042594
- GO:0043170
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043412
- GO:0043562
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044260
- GO:0044267
- GO:0044422
- GO:0044424
- GO:0044434
- GO:0044435
- GO:0044444
- GO:0044446
- GO:0044464
- GO:0050789
- GO:0050790
- GO:0050794
- GO:0050821
- GO:0050896
- GO:0051716
- GO:0051726
- GO:0065007
- GO:0065008
- GO:0065009
- GO:0071496
- GO:0071704
- GO:0071840
- GO:0080177
- GO:0080183
- GO:0097472
- GO:0140096
- GO:1901564
- GO:1901700
- GO:1902171
Pfam Term
- PF03109