HGT-Start

Notifications Mark All as Read

HGTStart is now Online

2 hrs ago

This is a TEST message

2 hrs ago

View All

Detail information of HGT record

HGT / Viridiplantae--Streptophyta--Setaria_italica.XP_004972470.1@@4555

Gene Information

HGT gene information.

Gene Name

XP_004972470.1
Donor Node

asReceptor
Donor Node

Eukaryota.Chromalveolate.Chromalveolate
DN time

1490.0
Receptor Node

Eukaryota.Viridiplantae.Streptophyta.Mesangiospermae
RN time

160.0
MSMH OUT

Chromalveolata.Alveolata--Gymnodiniales--Amphidinium_massartii_CS259.5365@@2951
AI(CHE)

18.06(100.0)
hU(CHS)

92.4(100.0)
hBL(CHBL)

97.71(100.0)
Node Level

1

MSMH IN

Viridiplantae--Tracheophyta--Setarit.XP_004972470.1@@4555
Viridiplantae--Tracheophyta--Panicha.XP_025821234.1@@206008
Viridiplantae--Tracheophyta--Zeama.NP_001339700.1@@4577
Plantae.Viridiplantae--Liliopsida--Oryza_brachyantha.XP_006659750.1@@4533
Viridiplantae--Tracheophyta--Brachdi.XP_003573287.1@@15368
Viridiplantae--Tracheophyta--Sorghbi.XP_002458405.1@@4558
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Gossypium_raimondii.XP_012462790.1@@29730
Plantae.Viridiplantae--Solanales--Solanum_tuberosum.XP_006353593.1@@4113
Plantae.Viridiplantae--Fabales--Vigna_radiata.XP_014520688.1@@157791
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Gossypium_hirsutum.XP_016698216.1@@3635
Plantae.Viridiplantae--Malvales--Theobroma_cacao.XP_007019886.2@@3641
Plantae.Viridiplantae--Fabales--Vigna_radiata.XP_014520687.1@@157791
Plantae.Viridiplantae--Brassical--Arabidopsis_lyrata.XP_020876620.1@@59689
Plantae.Viridiplantae--Malpighia--Populus_euphratica.XP_011036258.1@@75702
Plantae.Viridiplantae--Malpighia--Populus_trichocarpa.XP_006376172.1@@3694
Viridiplantae--Tracheophyta--Cucurpe.XP_023537901.1@@3663

Gene Annotation

Basic annotation, like KEGG, Gene Ontology etc.

OG1157 Term

OG.640
EGGNOG Term

KOG1676@1|root,KOG1676@2759|Eukaryota,37KHB@33090|Viridiplantae,3GBD4@35493|Streptophyta,3KW0F@4447|Liliopsida,3I4VX@38820|Poales
PANTHER Term

PTHR10288
Super Family Term

SSF54791
Interproscan Term
- ['IPR036612']
GO Term
- GO:0000976
- GO:0000977
- GO:0000978
- GO:0000981
- GO:0000982
- GO:0000987
- GO:0001012
- GO:0001067
- GO:0001077
- GO:0001228
- GO:0003674
- GO:0003676
- GO:0003677
- GO:0003690
- GO:0003700
- GO:0005488
- GO:0005575
- GO:0005622
- GO:0005623
- GO:0005634
- GO:0005737
- GO:0006139
- GO:0006351
- GO:0006355
- GO:0006357
- GO:0006366
- GO:0006725
- GO:0006807
- GO:0008150
- GO:0008152
- GO:0009058
- GO:0009059
- GO:0009889
- GO:0009891
- GO:0009893
- GO:0009987
- GO:0010467
- GO:0010468
- GO:0010556
- GO:0010557
- GO:0010604
- GO:0010628
- GO:0016070
- GO:0018130
- GO:0019219
- GO:0019222
- GO:0019438
- GO:0031323
- GO:0031325
- GO:0031326
- GO:0031328
- GO:0032774
- GO:0034641
- GO:0034645
- GO:0034654
- GO:0043170
- GO:0043226
- GO:0043227
- GO:0043229
- GO:0043231
- GO:0043565
- GO:0044212
- GO:0044237
- GO:0044238
- GO:0044249
- GO:0044260
- GO:0044271
- GO:0044424
- GO:0044464
- GO:0045893
- GO:0045935
- GO:0045944
- GO:0046483
- GO:0048518
- GO:0048522
- GO:0050789
- GO:0050794
- GO:0051171
- GO:0051173
- GO:0051252
- GO:0051254
- GO:0060255
- GO:0065007
- GO:0071704
- GO:0080090
- GO:0090304
- GO:0097159
- GO:0097659
- GO:0140110
- GO:1901360
- GO:1901362
- GO:1901363
- GO:1901576
- GO:1902680
- GO:1903506
- GO:1903508
- GO:1990837
- GO:2000112
- GO:2001141
Pfam Term
- PF00013